Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFKQ969G6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms