Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF4BQ92750 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms