Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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C11orf40Q8WZ69 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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C11orf40Q8WZ69 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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C11orf40Q8WZ69 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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C11orf40Q8WZ69 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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C11orf40Q8WZ69 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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C11orf40Q8WZ69 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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C11orf40Q8WZ69 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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C11orf40Q8WZ69 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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C11orf40Q8WZ69 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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