Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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RNF148Q8N7C7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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RNF148Q8N7C7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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RNF148Q8N7C7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RNF148Q8N7C7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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