Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC26■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms