Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD35Q8N283 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD35Q8N283 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD35Q8N283 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD35Q8N283 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD35Q8N283 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD35Q8N283 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD35Q8N283 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD35Q8N283 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD35Q8N283 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD35Q8N283 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD35Q8N283 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD35Q8N283 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD35Q8N283 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD35Q8N283 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD35Q8N283 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD35Q8N283 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD35Q8N283 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD35Q8N283 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD35Q8N283 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD35Q8N283 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD35Q8N283 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms