Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms