Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms