Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NLRP9Q7RTR0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms