Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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USP43Q70EL4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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USP43Q70EL4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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USP43Q70EL4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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USP43Q70EL4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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USP43Q70EL4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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USP43Q70EL4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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USP43Q70EL4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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USP43Q70EL4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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USP43Q70EL4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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USP43Q70EL4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP43Q70EL4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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