Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPOCD1Q6ZMY3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms