Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIGD1Q6UXZ0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms