Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OPN5Q6U736 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms