Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF6Q6KF10 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms