Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM78BQ5VT40 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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FAM78BQ5VT40 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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FAM78BQ5VT40 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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FAM78BQ5VT40 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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FAM78BQ5VT40 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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FAM78BQ5VT40 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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FAM78BQ5VT40 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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FAM78BQ5VT40 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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FAM78BQ5VT40 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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FAM78BQ5VT40 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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FAM78BQ5VT40 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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FAM78BQ5VT40 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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FAM78BQ5VT40 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FAM78BQ5VT40 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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