Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D3Q587I9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms