Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC93Q567U6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms