Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL22Q53GT1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms