Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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