Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC142Q17RM4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC142Q17RM4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms