Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYT16Q17RD7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT16Q17RD7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms