Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms