Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
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