Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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