Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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