Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 DROSHA-220ENST00000513349 4681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.841e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.841e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.841e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 TACC1-217ENST00000521866 1807 ntTSL 59.67□□□□□ -0.861e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 POGZ-201ENST00000271715 6626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.921e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 RBM5-201ENST00000347869 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.931e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 POGZ-205ENST00000409503 4813 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.941e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 RBM5-212ENST00000464087 5616 ntTSL 29.12□□□□□ -0.951e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.011e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 TACC1-205ENST00000518809 4116 ntTSL 1 (best)8.51□□□□□ -1.051e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.061e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 HMGN1-205ENST00000419378 850 ntTSL 28.26□□□□□ -1.098e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.116e-12■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 TACC1-221ENST00000522548 679 ntTSL 28.07□□□□□ -1.121e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.131e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.166e-12■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.164e-14■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.171e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 SEPT11-208ENST00000506731 659 ntTSL 57.17□□□□□ -1.264e-14■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 MGST1-208ENST00000535624 655 ntTSL 26.92□□□□□ -1.31e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 RCHY1-204ENST00000505105 1304 ntTSL 1 (best)6.72□□□□□ -1.338e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 SEPT11-202ENST00000502401 276 ntTSL 56.67□□□□□ -1.344e-14■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.351e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 POGZ-202ENST00000358476 6459 ntTSL 26.56□□□□□ -1.361e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.366e-12■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 RCHY1-207ENST00000512567 1164 ntTSL 1 (best)6.3□□□□□ -1.48e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 STX18-204ENST00000503861 840 ntTSL 56.22□□□□□ -1.418e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 ZFR-202ENST00000502988 2184 ntTSL 1 (best)6.18□□□□□ -1.426e-12■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 RAB3GAP1-204ENST00000487003 3506 ntTSL 56.14□□□□□ -1.436e-12■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.446e-12■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 SEPT11-214ENST00000513373 546 ntTSL 26.02□□□□□ -1.454e-14■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC5.97□□□□□ -1.456e-12■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 DCTN3-211ENST00000481438 401 ntTSL 25.84□□□□□ -1.471e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 ZFR-206ENST00000510369 1551 ntTSL 1 (best)5.8□□□□□ -1.486e-12■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 SEPT11-216ENST00000515671 507 ntTSL 25.54□□□□□ -1.524e-14■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 DROSHA-213ENST00000511778 1261 ntTSL 35.16□□□□□ -1.581e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 DROSHA-221ENST00000514927 567 ntTSL 24.81□□□□□ -1.641e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 ZFR-207ENST00000514356 3109 ntTSL 24.41□□□□□ -1.76e-12■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 SEPT11-215ENST00000513697 328 ntTSL 24.37□□□□□ -1.714e-14■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 TMEM161B-208ENST00000510089 7608 ntTSL 1 (best)3.58□□□□□ -1.841e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 RPS4X-205ENST00000492695 355 ntTSL 38.49□□□□□ -1.053e-34■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.067e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.077e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.127e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 AC093323.1-203ENST00000444232 1605 ntTSL 1 (best)26.66■■□□□ 1.861e-11■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.64■■□□□ 1.71e-11■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.421e-11■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 ECI1-206ENST00000566379 961 ntTSL 226.56■■□□□ 1.845e-8■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 PPP1R35-203ENST00000476185 474 ntTSL 224.66■■□□□ 1.546e-9■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 PPP1R35-202ENST00000470295 758 ntTSL 223.79■■□□□ 1.46e-9■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.098e-9■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 GLO1-202ENST00000470973 1939 ntTSL 28.97□□□□□ -0.978e-9■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.794e-8■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.64e-8■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.194e-8■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.694e-8■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 IRAK1-208ENST00000444230 1125 ntTSL 521.1■□□□□ 0.974e-12■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.124e-12■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 IRAK1-202ENST00000369974 3319 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.224e-12■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.027e-9■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 PRPF8-203ENST00000571958 380 ntTSL 312.36□□□□□ -0.437e-9■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 PRPF8-201ENST00000304992 7295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.67e-9■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 RPL23-201ENST00000245857 588 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.493e-85■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 SSRP1-202ENST00000293880 6296 ntTSL 217.5■□□□□ 0.392e-9■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 SSRP1-201ENST00000278412 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.312e-9■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.493e-8■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 STAT5A-209ENST00000588868 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.23e-8■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 TRIM28-213ENST00000598355 714 ntTSL 219.29■□□□□ 0.681e-19■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 RPP21-229ENST00000498414 1492 ntTSL 528.4■■■□□ 2.143e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.023e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 RPP21-226ENST00000473266 621 ntTSL 525.86■■□□□ 1.733e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.983e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.983e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 RPP21-228ENST00000491477 457 ntTSL 521.15■□□□□ 0.983e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 TRIM39-RPP21-201ENST00000623385 1698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.033e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 RPP21-223ENST00000436442 522 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.423e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 RPP21-227ENST00000489124 450 ntTSL 38.12□□□□□ -1.113e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.871e-8■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 CDT1-203ENST00000569140 571 ntTSL 315.21■□□□□ 0.031e-8■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.493e-16■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 03e-16■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 NAP1L1-224ENST00000552056 1981 ntTSL 55.38□□□□□ -1.552e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 UBXN1-206ENST00000525717 1257 ntTSL 325.4■■□□□ 1.664e-8■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 UBXN1-215ENST00000533476 1912 ntTSL 221.31■■□□□ 14e-8■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.954e-8■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 KRT19-205ENST00000471565 654 ntTSL 220.2■□□□□ 0.821e-6■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.724e-8■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 UBXN1-213ENST00000532904 2073 ntTSL 219.5■□□□□ 0.714e-8■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.464e-8■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.464e-8■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 KRT19-206ENST00000479031 427 ntTSL 217.86■□□□□ 0.451e-6■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.545e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 EIF3G-215ENST00000593095 636 ntTSL 313.5□□□□□ -0.251e-6■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 EIF3G-205ENST00000587993 555 ntTSL 313.22□□□□□ -0.291e-6■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.65e-8■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 DRG1-204ENST00000469673 677 ntTSL 28□□□□□ -1.135e-8■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 DRG1-206ENST00000548143 338 ntTSL 25.83□□□□□ -1.485e-8■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.493e-8■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.483e-8■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.453e-8■■□□□ 13.2
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