Protein–RNA interactions for Protein: Q13045

FLII, Protein flightless-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLIIQ13045 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FLIIQ13045 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms