Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms