Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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PTPN13Q12923 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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PTPN13Q12923 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.4□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
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