Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms