Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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