Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms