Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms