Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms