Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms