Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms