Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITPNAQ00169 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms