Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMC1P62191 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms