Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms