Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms