Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CASP9P55211 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CASP9P55211 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CASP9P55211 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP9P55211 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP9P55211 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP9P55211 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms