Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RAB5CP51148 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RAB5CP51148 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RAB5CP51148 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RAB5CP51148 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RAB5CP51148 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RAB5CP51148 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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RAB5CP51148 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RAB5CP51148 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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