Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TTPAP49638 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TTPAP49638 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTPAP49638 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTPAP49638 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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