Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL1P40616 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL1P40616 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL1P40616 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL1P40616 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL1P40616 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL1P40616 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL1P40616 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL1P40616 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL1P40616 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL1P40616 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL1P40616 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL1P40616 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL1P40616 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL1P40616 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL1P40616 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL1P40616 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL1P40616 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARL1P40616 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARL1P40616 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ARL1P40616 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARL1P40616 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARL1P40616 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARL1P40616 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARL1P40616 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARL1P40616 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms