Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTX2P32243 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTX2P32243 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms