Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APCP25054 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APCP25054 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
APCP25054 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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