Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP1P21291 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms