Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP4AP20648 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms