Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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