Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BMP4P12644 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BMP4P12644 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP4P12644 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms